वीवीपैट प्रणाली का सॉफ्टवेयर केंद्रीय रूप से स्थापित है और ईवीएम से जुड़ा है। परंतु वीवीपैट पर्चियों और इलेक्ट्रॉनिक वोटों के बीच यादृच्छिक मिलान मनमाना है, जिससे पारदर्शिता पर संदेह उठता है। चुनाव आयोग के सीमित खुलासे ने मतदान प्रणाली की अखंडता को लेकर सार्वजनिक चिंताएं पैदा की हैं।